戰(zhàn)國(guó)時(shí)代──以恐怖來(lái)統(tǒng)治天下最兇最?lèi)旱奈鋵ⅰ把拦砘迷?0s。由“伊賀崎家”率領(lǐng)的一群忍者，經(jīng)過(guò)激烈的戰(zhàn)斗，打倒了“牙鬼幻月”。但“牙鬼幻月”卻留下了不詳?shù)念A(yù)言…“444年后，我將變成妖怪復(fù)活再次以恐怖支配天下！”時(shí)光流逝——終結(jié)忍者“伊賀崎好天”跟復(fù)活的妖怪“牙鬼幻月”決斗，并成功將它封印。時(shí)光再次流逝到了現(xiàn)代──“牙鬼幻月”的封印被解除，“牙鬼幻月”的怨念生出了一批妖怪，這些妖怪們組成“牙鬼軍團(tuán)”，為了讓“牙鬼幻月”完全復(fù)活，妖怪們到處搜集人們的恐懼心，開(kāi)始向人們展開(kāi)襲擊！緊急時(shí)刻，出現(xiàn)了5個(gè)年輕人。他們正是伊賀崎家的末裔，也就是終結(jié)忍者?伊賀崎好天的孫子們！“當(dāng)忍則忍，可不忍則不忍！”三代同堂，用火熱的“忍者心”（Nintality）以及各種異想天開(kāi)的忍術(shù)來(lái)漂亮的擊退妖怪！為了繼承祖父的“終結(jié)忍者”這個(gè)封號(hào)，也為了阻止妖怪軍團(tuán)讓“牙鬼幻...

戰(zhàn)國(guó)時(shí)代──以恐怖來(lái)統(tǒng)治天下最兇最?lèi)旱奈鋵ⅰ把拦砘迷?89電影。由“伊賀崎家”率領(lǐng)的一群忍者，經(jīng)過(guò)激烈的戰(zhàn)斗，打倒了“牙鬼幻月”。 但“牙鬼幻月”卻留下了不詳?shù)念A(yù)言… “444年后，我將變成妖怪復(fù)活再次以恐怖支配天下！”時(shí)光流逝—— 終結(jié)忍者“伊賀崎好天”跟復(fù)活的妖怪“牙鬼幻月”決斗，并成功將它封印。時(shí)光再次流逝到了現(xiàn)代──“牙鬼幻月”的封印被解除， “牙鬼幻月”的怨念生出了一批妖怪，這些妖怪們組成“牙鬼軍團(tuán)”， 為了讓“牙鬼幻月”完全復(fù)活，妖怪們到處搜集人們的恐懼心，開(kāi)始向人們展開(kāi)襲擊！緊急時(shí)刻，出現(xiàn)了5個(gè)年輕人。 他們正是伊賀崎家的末裔，也就是終結(jié)忍者?伊賀崎好天的孫子們！“當(dāng)忍則忍，可不忍則不忍！” 三代同堂，用火熱的“忍者心”（Nintality）以及各種異想天開(kāi)的忍術(shù)來(lái)漂亮的擊退妖怪！為了繼承祖父的“終結(jié)忍者”這個(gè)封號(hào)，也為了阻止妖怪軍團(tuán)讓“牙鬼幻月”復(fù)活， 他們不僅不忍，還要大肆反擊！

牙鬼との激闘から2年、それぞれの夢(mèng)に向かって旅立った6人は好天の三回忌をきっかけに再び忍術(shù)道場(chǎng)に集まっ策馳影院。そこへ突如現(xiàn)れた牙鬼の殘黨を相手にお互い成長(zhǎng)した姿を見(jiàn)せ合うように妖怪を倒していく天晴達(dá)。中でもガシャドクロを生身で倒してしまう風(fēng)花と霞の成長(zhǎng)に驚く一同。なんとこの2年、2人は強(qiáng)さと人気を兼ね備えたアイドル忍者“ニンニンガールズとして平和を守っていたのだった!　　戦いを終え久々の再會(huì)を喜ぶ6人の前に「久しぶりね天晴」とまさかの人物、天晴と風(fēng)花の母?桜子が現(xiàn)れた。しかも風(fēng)花と霞を誘い“ニンニンガールズをプロデュースしているというのだ。さらに世界進(jìn)出を考える桜子から“伊賀崎流の名前をかけて“ニンニンガールズと真剣勝負(fù)を提案される天晴、八雲(yún)、凪、キンジの4人は“ニンニンボーイズとして受けて立つこととなった。この試合もアピールの場(chǎng)として使おうとする桜子は、新メンバー?九重ルナの加入をサプライズ発表。さらにミドニンジャーシュリケンを勝手に與える暴走っぷり。そして數(shù)合わせとして旋風(fēng)も加わり4対4の真剣勝負(fù)が始まった。　　時(shí)を同じくして、執(zhí)念の復(fù)活を遂げた有明の方が萬(wàn)月の復(fù)活と、真剣勝負(fù)を利用したニンニンジャーの分裂を企て暗躍を開(kāi)始する――。　　果たしてニンニンジャーは再び世界の平和を守ることが出來(lái)るのか!